เมื่อใช้บริการ OTP ที่เป็น Multi-Factor Authentication (MFA) แล้วก็เปรียบเสมือนมีกระบวนการป้องกันความปลอดภัยเพิ่มเติม โดย SMS OTP จะทำให้ขั้นตอนการเข้าถึงบัญชี หรือข้อมูลมีความรัดกุมมากขึ้น เนื่องจากจำเป็นจะต้องใส่รหัส OTP ที่ได้รับให้ถูกต้อง มิฉะนั้นก็ไม่สามารถเข้าถึงบัญชีหรือข้อมูลนั้น ๆ ได้